全球治理主体结构中，联合国与非政府组织的关系经历了由单一的垂直咨商向更加灵活、包容的多元合作伙伴关系转变。权力逻辑、制度逻辑、能力逻辑相互作用，塑造了关系变迁的基本脉络和主体间合作模式。联合国与非政府组织的合作虽然已经由单一的结构性合作向关系性、规范性合作模式扩展，但在代表性、效率与问责方面仍面临挑战，亟须协调三重逻辑以提升治理效能。协同治理作为一种新兴治理模式，在全球气候治理实践中表现出主体间协调和动员优势。通过聚焦《联合国气候变化框架公约》进程中的联合国与非政府组织互动，可以发现该模式通过制度创新、软性治理与网络协调，有效推动了三重逻辑协调整合。制度路径的调整和优化是实现联合国与非政府组织稳定合作的重要突破口。